亚洲第一品牌威尼斯澳门人院讯（通讯员：高震）近日，Springer Nature出版社旗下BMC系列期刊BMC Bioinformatics在线发表了我院学术论文（Zhen Gao, Yu-Tian Wang, Qing-Wen Wu, Jian-Cheng Ni, Chun-Hou Zheng. Graph regularized L2,1-nonnegative matrix factorization for miRNA-disease association prediction, BMC Bioinformatics, 21(61), 2020）。该论文以威尼斯亚洲第一品牌威尼斯澳门人为第一完成单位，2018级研究生高震为论文第一作者，倪建成教授和郑春厚特聘教授为论文共同通讯作者。BMC Bioinformatics是生物信息学领域重要期刊，最新影响因子3.242，中科院分区2区。

针对当前miRNA和疾病相似性信息不完整，已知miRNA-疾病关联非常稀疏以及NMF算法不够完善的问题，GRL2,1-NMF首先度量miRNA和疾病的相似性，引入了高斯核相似性以丰富相似性信息，从而构建miRNA-疾病异构网络；由于miRNA-疾病关联矩阵极为稀疏，因此对miRNA-疾病关联矩阵进行加权K近邻处理；另外，在非负矩阵分解算法中引入吉洪诺夫正则化、拉普拉斯正则化和L2,1正则化，从而降低了过拟合，增强了数据平滑性，提高了预测潜在的miRNA-疾病对性能。最后采用五折交叉验证、留一验证以及案例研究对其进行性能评估。

全文链接：https://doi.org/10.1186/s12859-020-3409-x

该研究得到了国家自然科学基金的资助支持。